Geomorfológicamente, la zona donde se asienta la parroquia se encuentra influenciada por la cordillera Real y la llanura amazónica, razón por la cual las alturas varían desde los 180 msnm en la llanura aluvial amazónica a los 320 msnm en la zona de las colinas medianas y una pendiente de suelo característica clasificada como “muy suave”, cuyos valores se encuentra entre el 2-5%. (mapa 1-4)
En la parroquia San Sebastián del Coca el relieve de la mayor superficie corresponde a llanura aluvial o también llamada llanura de inundación, seguido de zonas de colinas medias, que cruza dentro de la parroquia y el resto de superficie pertenece a pequeños relieves conocidos como “terrazas”, según se describe a continuación:
El territorio compuesto de llanuras aluviales inundadas debido a su fácil acceso y a que presentan una fertilidad relativa, son fuentes de abastecimiento de la mayor parte de los recursos naturales que son extraídos en la parroquia, y que permiten el sostenimiento de la mayoría de la población de la parroquia.
A lo largo del territorio los ríos están encauzados, protegiendo los asentamientos humanos que se han implantado en estas zonas por la accesibilidad al recurso agua desde la antigüedad. Sin embargo, la presencia de la topografía de llanuras aluviales se tratan de zonas vulnerables que puede ser inundadas ante una eventual crecida del cauce, y de zonas de conos de deyección donde los lechos del río podrían desplazarse fácilmente, inundando incluso zonas más alejadas del territorio.